原料清理目的是除去玉米中的铁、砂、石、茎等非原料物质，保证设备正常运行，提高淀粉质量。玉米原料经斗式提升机输送依次进入清理筛、磁选器等设备进行筛选、去石等净化工序，净化玉米计量后进入跳汰机进行湿法去石。

一般采用硫磺燃烧制取亚硫酸溶液工艺，通过三级洗涤确保尾气浓度达标。根据当地情况，也可以使用液态二氧化硫或亚硫酸氢钠等作为制酸原料。

浸泡是玉米淀粉生产的关键工序，浸泡质量直接影响出粉率和淀粉的质量。浸泡的目的是改变胚乳的结构和物理化学性能，削弱淀粉联结、降低玉米籽粒的强度，浸出可溶性物质，并抑制微生物孽生。

含固形物的稀玉米除去杂质后进入废热蒸发系统进行蒸发浓缩至含固形物大于43%，加入纤维中一起烘干成蛋白饲料。蒸发器采用管束干燥机废汽作为热源，不需要添加生蒸汽。

浸泡后的玉米由湿玉米输送泵经除石器进入湿玉米贮斗，再进入一级脱胚磨，将玉米破碎成4～6瓣，含整形玉米量不超过1%，并分出75%～89%的胚芽，同时释放出20%～25%的淀粉。破碎后的玉米用胚芽泵送至一级胚芽旋流器，一级胚芽旋流器顶部流出的胚芽去洗涤系统，一级胚芽旋流器底流物进入二级脱胚磨，玉米破碎为10～12瓣，在此浆料中不含整粒玉米，处于结合状态的胚芽不超过0.3%，经过二次破碎的浆料经胚芽泵送入二级胚芽旋流器，二级胚芽旋流器顶流物通过一磨储罐重新进入一级胚芽分离器，二级胚芽旋流器底流浆料入细磨工序。

经过二次胚芽旋流器分离出胚芽后的稀浆料通过压力曲筛，筛下物为粗淀粉乳，粗淀粉乳与纤维洗涤分离出的粗淀粉浆液汇合后进入淀粉分离工序；筛上物进入针磨进行细磨，以最大限度使与纤维联结的游离淀粉游离出来。经磨碎后的浆料中，联结淀粉不大于15%。细磨后的浆料进入纤维洗涤槽。

细磨后的浆料进入纤维洗涤槽，在此与之后的洗涤纤维的洗涤水一起送至第一级压力曲筛。筛下分离出粗淀粉乳，筛上物再经过6级压力曲筛逆流洗涤，洗涤工艺水从最后一级筛前加入，通过筛面，携带洗涤下来的游离淀粉逐级向前移动，直到第一级筛前洗涤槽中，与细磨后的浆料合并，共同进入第一级压力曲筛，分出粗淀粉乳，该淀粉乳与细磨前筛分出的粗淀粉乳汇合，进入淀粉精制工序。

从细磨前曲筛和纤维洗涤曲筛分离得到的粗淀粉经除砂器、旋转过滤器去除杂质后，进入麸质分离机，从麸质离心分离机得到的底流送至洗涤分离旋流器中进行洗涤精制。

精制后的淀粉乳采用刮刀离心机进行脱水，脱水后的淀粉通过气流干燥进行干燥，成品淀粉至包装车间。

排出的溢流物含有较多麸质，分离得到的轻质麸质（1.5～2%干物质）送至麸质浓缩机中浓缩到9%～12%，再经真空转鼓过滤机或板框压滤机脱水。脱水后的蛋白进入管束干燥机进行干燥，干燥后的蛋白输送至包装车间。

自一级胚芽旋流器顶部流出的胚芽，经三级曲筛洗涤后（含水85%），洗去粘附在胚芽上的湿粉颗粒，进入胚芽挤干机，经脱水后湿胚芽含水低于53%，去管束干燥机进行烘干后，胚芽风运至副产品仓库先进行降温冷却处理，再进行包装。

洗涤后的纤维经纤维挤干机脱水后再用管束干燥机进行干燥，干燥后的纤维饲料粉碎后通过风运冷却系统送至包装车间。